Sujet de thèse : Evaluer la toxicité des sédiments des milieux aquatiques d’eau douce : Proposer
l’amphipode Gammarus fossarum comme espèce européenne pour le développement de nouveaux
bio-essais normalisés.

Partenaire industriel employeur : BIOMAE

Laboratoire d’accueil : INRAE, UR RiverLy, Laboratoire d’écotoxicologie, Lyon-Villeurbanne

Problématique :

Il s’agit de développer et proposer un/des nouveaux bioessais pour l’évaluation de la toxicité
des sédiments d’eau douce afin d’intégrer dans les évaluations actuelles des espèces présentes dans
nos systèmes aquatiques européens. Il s’agit notamment d’utiliser l’amphipode Gammarus fossarum
et d’adapter les méthodologies déjà disponibles et normalisées pour mesurer divers marqueurs de
toxicité (survie, taux d’alimentation et reproduction). Le sujet de thèse proposé, s’articule autour de
la collaboration entre deux partenaires académiques, INRAE et l’université de Bordeaux (UMR EPOC)
et un partenaire privé, Biomae. INRAE de Lyon, et plus particulièrement l’équipe d’écotoxicologie, a
été à l’initiative des travaux développés chez le gammare encagé pour le suivi de la qualité des milieux
aquatiques, donnant lieu à la proposition d’outils qui ont été transférés vers la sphère privée à travers
la création de la spin off Biomae. Le laboratoire LPTC (UMR EPOC, université de Bordeaux) est reconnu
aux niveaux national et international pour ses développements et ses compétences en chimie
environnementale, pour la recherche et la quantification de substances à l’état d’ultra-trace et le
développement de méthodes pour la recherche de composés émergents. Enfin, Biomae dispose et
maitrise la production d’organismes tests (calibration par la taille, sexe et statut reproducteur) chez
l’espèce Gamamrus fossarum, ainsi que les protocoles pour mesurer divers marqueurs de toxicité.

Les objectifs du sujet de thèse proposé:
- Sur la base de travaux menés dans le cadre de la thèse de C. Durand
et des normes disponibles chez cette espèce, des protocoles seront développés et proposés pour
mesurer la survie, le taux d’alimentation et la reproduction chez G. fossarum.
- Etudier et quantifier les effets de facteurs confondants associés aux sédiments (granulométrie,
teneur en matière organique) sur les réponses biologiques mesurées chez G. fossarum et utilisées
comme marqueurs de toxicité. Le but ici est de développer un référentiel qui intègre les effets de ces
facteurs et de le proposer comme contrôle pour l’interprétation des résultats en terme d’impact
spécifique lié à la présence d’une contamination biodisponible.
- Valider le/les bioessais chez G. fossarum pour évaluer la toxicité de sédiments, via l’étude de
sédiments dopés et naturels.

RENSEIGNEMENTS COMPLEMENTAIRES

https://www.abg.asso.fr/fr/candidatOffres/show/id_offre/115250/job/these-cifre